Forskare kartlägger havrens stora, komplexa arvsmassa.

Ett internationellt forskarteam, där bland andra Sofi Marmon vid Lunds tekniska högskola (LTH)  ingick, har lyckats kartlägga hela arvsmassan hos havre – en bedrift som länge varit en utmaning på grund av växtens mycket stora och komplexa genom. Resultaten presenteras i den vetenskapliga tidskriften Nature.

Forskarna har skapat en så kallad pangenomkarta, som visar den genetiska variationen hos 33 olika havresorter, både odlade och vilda. De har också tagit fram en pantranskriptomkarta, som visar vilka gener som är aktiva i olika delar av växten, såsom blad, rötter och frön, samt under olika utvecklingsstadier.

Upptäckterna ger ny kunskap som kan få stor betydelse för framtidens havreförädling, jordbruk och hälsa. Forskarna fann bland annat att vissa gener har försvunnit i ett av havrens tre subgenom, men att gener i de andra delarna kompenserar för detta. De såg också att genetiska skillnader påverkar viktiga egenskaper som blomningstid och avkastning samt att förändringar i kromosomernas struktur har påverkat hur olika havresorter utvecklats.

Läs mer i den vetenskapliga artikeln i Nature: A pangenome and pantranscriptome of hexaploid oat